การวิเคราะห์ข้อมูลทางพันธุกรรมในสนามช่วยลดความกังวลว่าจะมีสายพันธุ์ที่แพร่ระบาดได้มากขึ้น
เมื่อมีการระบาดของไข้เลือดออกจากไวรัสในไนจีเรียในปี 2018 สล็อตเว็บตรง นักวิทยาศาสตร์พร้อมแล้ว: พวกเขาอยู่ในประเทศเพื่อทดสอบเทคโนโลยีติดตามโรคแบบใหม่ และภายในไม่กี่สัปดาห์ก็สามารถควบคุมเจ้าหน้าที่สาธารณสุขให้ได้รับการตอบสนองที่เหมาะสมที่สุด
ไข้ลาสซาซึ่งติดต่อจากหนูสู่คน มักมีขึ้นทุกปีในแอฟริกาตะวันตก แต่ปี 2018 เป็นฤดูกาลที่แย่ที่สุดในประวัติศาสตร์ของไนจีเรีย ภายในกลางเดือนมีนาคม มีผู้ป่วยที่ได้รับการยืนยัน 376 ราย มากกว่าสามเท่าในปี 2560 และผู้ต้องสงสัยอีก 1,495 ราย เจ้าหน้าที่สาธารณสุขไม่แน่ใจว่าปีที่ไม่ดีนั้นเกิดจากสายพันธุ์ที่มักจะหมุนเวียน หรือโดยสายพันธุ์ใหม่ที่อาจจะแพร่เชื้อระหว่างมนุษย์ได้ง่ายกว่าและรับประกันว่าจะมีการตอบสนองที่แข็งแกร่งขึ้น
เทคโนโลยีใหม่สำหรับการวิเคราะห์ DNA ในภาคสนามช่วยตอบคำถามนั้นในช่วงกลางการระบาด โดยยืนยันว่าการระบาดนั้นเกิดจากสายพันธุ์เดียวกันที่ส่งจากหนูสู่มนุษย์ในหลายปีที่ผ่านมา การค้นพบอย่างรวดเร็ว ดังกล่าวช่วยให้ไนจีเรียกำหนดรูปแบบการตอบสนอง โดยอนุญาตให้เจ้าหน้าที่สาธารณสุขมุ่งเน้นความพยายามในการควบคุม หนูและการจัดเก็บอาหารที่ปลอดภัย แทนที่จะลดเวลาและเงินลงในมาตรการที่มุ่งหยุดการแพร่เชื้อจากคนสู่คน ที่ไม่น่าจะเป็นไปได้.
ในขณะที่นักวิทยาศาสตร์กำลังรายงานผลของพวกเขาไปยังศูนย์ควบคุมโรคไนจีเรีย พวกเขากำลังหารือข้อมูลกับนักไวรัสวิทยาและนักระบาดวิทยาคนอื่นๆ ในฟอรัมออนไลน์ Nicholas Loman นักพันธุศาสตร์ด้านจุลินทรีย์จากมหาวิทยาลัยเบอร์มิงแฮมในอังกฤษซึ่งไม่ได้มีส่วนร่วมในการวิจัยกล่าว
ซีเควนเซอร์ดีเอ็นเอแบบพกพา ซึ่งบางอันมีขนาดเล็กเท่าโทรศัพท์มือถือ ได้อนุญาตให้นักวิทยาศาสตร์อ่านข้อมูลทางพันธุกรรมของไวรัสที่เกิดขึ้นในสถานที่ต่างๆ ที่ไม่มีโครงสร้างพื้นฐานในห้องปฏิบัติการที่กว้างขวาง การค้นหาความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างกลุ่มตัวอย่างผู้ป่วยสามารถให้เบาะแสว่าไวรัสถูกส่งไปอย่างไรและไวรัสเปลี่ยนแปลงไปอย่างรวดเร็วเพียงใดเมื่อเวลาผ่านไป ซึ่งเป็นข้อมูลสำคัญสำหรับการควบคุมการแพร่ระบาด หาก DNA ของไวรัสจากผู้ป่วยหลายรายมีความคล้ายคลึงกันมาก นั่นแสดงว่าไวรัสอาจติดต่อระหว่างคนได้ หากดีเอ็นเอมีความชัดเจนมากกว่า ผู้คนอาจจับไวรัสโดยไม่ขึ้นกับสัตว์อื่น
เทคโนโลยีนี้ยังถูกใช้ท่ามกลางการระบาดของอีโบลาและซิกาเมื่อเร็วๆ นี้อีกด้วย
แต่ไวรัส Lassa นำเสนอความท้าทายที่ไม่เหมือนใคร กล่าวโดย Stephan Günther ผู้เขียนร่วมการศึกษา นักไวรัสวิทยาที่สถาบัน Bernhard-Nocht-Institute for Tropical Medicine ในฮัมบูร์ก ประเทศเยอรมนี กล่าว Lassa มีความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างสายพันธุ์ต่างๆ มากมาย ซึ่งแตกต่างจากอีโบลาหรือซิกา ดังนั้นในขณะที่สามารถระบุส่วนเล็กๆ ของดีเอ็นเอเดียวกันจากสายพันธุ์ต่างๆ ของอีโบลาหรือซิกาสำหรับการวิเคราะห์ได้ แต่ก็ยากที่จะกำหนดเป้าหมายบริเวณที่คล้ายกันอย่างแม่นยำเพื่อเปรียบเทียบระหว่างสายพันธุ์ลาสซา
Güntherและทีมของเขาใช้กลยุทธ์ที่เรียกว่า metagenomics: พวกเขารวบรวมน้ำนมแม่ พลาสมา และน้ำไขสันหลังจากผู้ป่วยและจัดลำดับ DNA ทั้งหมดภายใน — มนุษย์ ไวรัส และสิ่งอื่น ๆ ที่ซุ่มซ่อน จากนั้น ทีมงานได้เลือก DNA ของไวรัส Lassa จากชุดข้อมูลนั้น
นักวิทยาศาสตร์ได้วิเคราะห์ DNA ของไวรัส Lassa จากผู้ป่วย 120 ราย มากกว่าที่ตั้งใจไว้ในตอนแรก “เราไปภาคสนามเพื่อทำการศึกษานำร่อง” กุนเธอร์กล่าว “จากนั้นการระบาดก็มาถึง และเราก็ขยายขนาดอย่างรวดเร็ว” ความสัมพันธ์ที่มีอยู่ก่อนในไนจีเรียช่วยให้สิ่งนั้นเกิดขึ้น: ทีมงานได้ร่วมมือกับนักวิจัยที่โรงพยาบาลการสอนเฉพาะทางของ Irrua และทำงานร่วมกับองค์การอนามัยโลกและศูนย์ควบคุมโรคของไนจีเรียมาเป็นเวลาสิบปี
การวิเคราะห์และตีความข้อมูลจำนวนมหาศาลที่สร้างขึ้นโดยแนวทางเมตาเจโนมิกส์ถือเป็นความท้าทาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อมีการเชื่อมต่ออินเทอร์เน็ตที่จำกัด Günther กล่าว นักวิจัยวิเคราะห์ 36 ตัวอย่างระหว่างการระบาด – น้อยกว่าหนึ่งในสามของชุดข้อมูลทั้งหมด แต่ก็ยังเพียงพอที่จะเป็นแนวทางในการตอบสนอง การวิเคราะห์ฉบับสมบูรณ์ซึ่งเสร็จสิ้นหลังจากการระบาด ยืนยันการค้นพบเบื้องต้น
แนวทางเมทาจีโนมิกส์อาจเป็นประโยชน์ในการเฝ้าระวังโรคในวงกว้างมากขึ้น ปัจจุบัน “เรามองหาสิ่งที่เรารู้และคาดว่าจะพบ ทว่าหลักฐานจากอีโบลาในแอฟริกาตะวันตกและซิกาในอเมริกาก็คือเชื้อโรคที่อุบัติขึ้นใหม่สามารถปรากฏขึ้นในที่ที่ไม่คาดคิด และใช้เวลานานเกินไปกว่าจะเป็นที่รู้จัก” โลแมนกล่าว เขากล่าวว่าการจัดลำดับดีเอ็นเอทั้งหมดในตัวอย่างจะช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถตรวจหาเชื้อโรคที่เป็นปัญหาก่อนที่จะทำให้เกิดการระบาดได้ สล็อตเว็บตรง
